De CEToolbox-applicatie is een calculator voor capillaire elektroforese. Het beoogt verschillende informatie te verschaffen over de scheiding van verbindingen zoals de hydrodynamische injectie, het volume van het capillair, de lengte van de injectieplug of de hoeveelheid geïnjecteerde analyt. De applicatie werkt met elk type CE-systeem.
CEToolbox is een gratis applicatie, ontwikkeld met Java en vrijgegeven onder de Apache-licentie. De broncode is beschikbaar op de GitHub-website. Meer informatie is te vinden op https://cetoolbox.github.io.